选择论文查重软件时，首先要考虑其查重算法的准确性和全面性。其次，要关注软件的使用便捷性和数据安全性。最好选择支持多种文件格式和多语言的软件，以适应不同类型的学术文献。另外，了解软件的价格和售后服务也很重要。

在学术文献检索中，论文查重软件的高级应用包括但不限于：自定义查重参数、批量处理文献、生成查重报告等功能。这些高级功能可以帮助用户更加方便快捷地进行文献查重工作，提高工作效率和准确性。选择功能丰富、操作简便的软件对于学术研究人员来说尤为重要。